1 材料與方法
實驗中所使用的主要儀器及試劑有: SW-CJ 超凈工作臺(蘇州安提空氣技術(shù)有限公司)、SPX 系列生化培養(yǎng)箱(寧波江南儀器廠)、ELGA 超純 水儀(英國 ELGA 公司)、XW-80A 旋渦振蕩儀(海門市其林貝爾儀器制造有限公司)、D3024 離心機 (Eppendorf 有限公司)、YXQG02 高壓蒸汽滅菌鍋 (致微儀器有限公司)、細菌 DNA 提取試劑盒(中 國天根生化科技有限公司)、真菌 DNA 提取試劑 盒 ( 北京方程生物科技有限公司 ) 、 API20NE (bioMerieux, 法國)、PCR 反應試劑(大連寶生物 工程有限公司)。細菌培養(yǎng)基(2216E 培養(yǎng)基): 蛋白胨 5 g, 酵 母粉 1 g, 瓊脂 18 g, 陳海水 1 000 mL, 高溫高壓 滅菌 20 min。真菌培養(yǎng)基(PDA 培養(yǎng)基): 土豆 200 g, 葡萄糖 10 g, 瓊脂 17 g, 陳海水 1 000 mL, 高溫高壓濕熱滅菌 20 min。產(chǎn)酶培養(yǎng)基分別為: 產(chǎn)淀粉酶培養(yǎng)基, 產(chǎn)酪蛋白酶培養(yǎng)基, 產(chǎn)纖 維素酶培養(yǎng)基。
2 結(jié)果
將測得的細菌、真菌基因序列通過 Blast 程 序與 GenBank 中核酸數(shù)據(jù)庫進行對比分析, 使用 N-J 法建樹, 。獲得的 78 株細菌(數(shù)據(jù)根據(jù)鑒定表來 確定)的序列在 NCBI 中選擇與 GenBank 中的參考 菌株 16S rDNA 序列進行比較分析后, 其相似度 均在 98%—100%之間, 而 XD2、3D1 這 2 株菌株 相似度分別為 97%、95%, 可能代表了潛在的細 菌新物種。
3 討論
獲得可培養(yǎng)微生物是微生物資源利用的基礎(chǔ), 在南極可培養(yǎng)微生物多樣性研究方面, 目前取得 了一定的研究成果。本研究通過對南極羅斯海區(qū) 域沉積物的細菌、真菌進行分離、純化和培養(yǎng), 基 于 16S rDNA、ITS 基因序列進行了系統(tǒng)發(fā)育分析, 最終獲得含有 13 個屬的細菌 78 株、5 個屬的真 菌 54 株。Bowman 等也利用 16S rDNA 分子鑒 定, 發(fā)現(xiàn)南極海冰中細菌種群的主要部分是 Proteobacteria 類群。
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